Агент Итан Хант во время исполнения секретной миссии в Москве был раскрыт, после чего террористы устроили взрывы на Красной площади и в Кремле. Несмотря на то, что ему удалось вовремя сбежать, Хант вскоре обнаружил, что он и вся разведка стали козлами отпущения. Под давлением российского правительства президент США запустил «Призрачный договор», полностью распустив разведывательное агентство.\ В крайне неблагоприятной ситуации, потеряв все ресурсы и поддержку, Итан Хант должен самостоятельно найти выход, очистить разведку от обвинений и вместе с новой командой предотвратить взрыв ядерной бомбы опасным врагом, который может уничтожить мир.[Подробнее]\ В серии фильмов «Миссия невыполнима» Том Круз всегда выступал как бесстрашный, энергичный и неуязвимый человек справедливости, берущий на себя любые опасности, снося все трудности и обиды. Его строгая мораль, ловкость, обширные знания могли бы в Китае почти заслужить титул «Живой Лэй Фэн, тронувший Китай». Именно поэтому Том Круз и его серия «Миссия невыполнима» в эпоху, когда героизм постепенно становится устаревшим, начали терять признание зрителей. От ошеломляющей премьеры «Миссии невыполнима» до всеобщего внимания «Миссии невыполнима 2», а затем до критики «Миссии невыполнима 3», серия стремительно шла от славы к критическому положению, пока никто, кроме самого Тома Круза, не соглашался финансировать или снимать «Миссию невыполнима 4». Том Круз, который особенно любит боевики, не хотел отказываться от «Миссии невыполнима», поэтому после нескольких лет подготовки инвестировал в фильм и сыграл в этом высокобюджетном экшне «Миссия невыполнима 4: Протокол Фантом».\ В «Миссии невыполнима 4» Том Круз по-прежнему мускулист и ловок, с увлечением рискует жизнью, но в отличие от предыдущих фильмов серии он больше не сосредотачивается только на отражении личного обаяния, а формирует элитную команду. Присоединение команды ослабляет оттенок героизма, но делает больше деталей забавными. Во время выполнения миссии в Кремле команда Тома Круза использует высокие технологии, чтобы преодолеть многочисленные препятствия, но в конце их планы портят другие российские экстремисты, не разбирающиеся в высоких технологиях.Когда Том Круз был вынужден карабкаться руками по стеклянной внешней стене Бурдж-Халифа, он уже не бросался вперёд с прежней смелостью, а откладывал это дело вместе с другими членами команды. В конце концов, хотя его всё же заставили подняться, магнитные перчатки разрядились на полпути, и он был вынужден наблюдать, как перчатки падают с высоты более 800 метров; а его элитная команда оказывалась ещё более трусливой и боязливой, чем он сам — выполняя задание, они то нервно бормотали, то делали растяжку, чтобы успокоить страх. В общем, в «Миссии невыполнима: Протокол Фантом» агенты больше не выглядят исключительно как героям «высоким и идеальным», а становятся более человечными и со смыслом к юмору. Хотя Том Круз всё ещё демонстрирует свои мышцы, он больше не возлагает на себя все великие подвиги, а устраивает себе различные смешные и неудачные ситуации, показывая свою милую сторону, решая трудные задачи.
Помимо юмористического сюжета, другой важный момент фильма — это различные «забавные» маленькие гаджеты. Их называют «забавными», потому что, хотя они высокотехнологичны, как в продукции Джеймса Бонда, они часто подводят в ключевые моменты, как в фильме Чоу Синг-чи «Жизнь в квадрате». Помимо уже упомянутых разрядившихся магнитных перчаток, в этом фильме Том Круз сталкивается с такими неудачами, как: использование спутниковой системы для побега из тюрьмы, что приводит к хаосу в порядке заключения; высококлассный телефон с функцией распознавания лица теряет сигнал во время песчаной бури; попытка создать голографический проектор в конце коридора с помощью камеры и планшета едва не приводит к тому, что его лицо проецируется на экран.
